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単細胞性か群体性で，細胞の前端部（頭部）にくぼみがあり，そこから外に伸びでた鞭毛は片羽型で，細胞の表面部に外皮（ペリクル）と呼ばれる構造があり，貯蔵物質としてパラミロンという多糖類をもつという共通した特性があり，葉緑体をもつものは光合成色素としてクロロフィルa,
b を含んでいる．葉緑体をもち光合成をする光栄養を営むもののほかに，吸収栄養や摂食栄養を営む無色の種類も多数含まれる．
ミドリムシという名前も有るように，植物と動物の中間的な生物であるとも言える．淡水域，汽水域，内湾の海水域に広く生息する．30数属800種以上が知られている．
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